ma puoi cambiare colori dello sfondo e dei caratteri, oltre che, naturalmente, variare la luminosità

Ma resta sempre una retroilluminazione classica, non naturale, praticamente un led puntato in faccia. Invece l'illuminazione del kindle (quelli che ce l'hanno) non è posteriore, è laterale e puntata sullo schermo e non dà fastidio alla vista. Se invece leggi con la luminosità a zero è come leggere un libro, da questo punto di vista la differenza tra uno schermo e-ink e uno classico è enorme.

Ma su un kindle posso metterci i pdf non  pezzotti scaricat molto legalmente  da internet?

Li devi convertire.